Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG4DQ86TL0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms