Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z494

NPHP3, Nephrocystin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3Q7Z494 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP3Q7Z494 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP3Q7Z494 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms