Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BEND4Q6ZU67 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms