Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms