Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms