Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GARNL3Q5VVW2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms