Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDSS1Q5T2R2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms