Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms