Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC92Q53HC0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC92Q53HC0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms