Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms