Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN2Q504Q3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms