Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF8Q3BBV2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms