Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXNQ16595 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXNQ16595 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FXNQ16595 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FXNQ16595 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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