Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms