Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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