Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

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Length 3,267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPEGQ15772 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPEGQ15772 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms