Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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IRF4Q15306 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms