Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB35Q15286 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RAB35Q15286 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB35Q15286 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB35Q15286 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms