Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EEA1Q15075 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms