Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAPVD1Q14C86 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAPVD1Q14C86 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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