Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CHD4Q14839 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHD4Q14839 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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