Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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