Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFTN1Q14699 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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