Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNIQ14094 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNIQ14094 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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