Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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COL4A6Q14031 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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COL4A6Q14031 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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COL4A6Q14031 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL4A6Q14031 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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