Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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