Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CUL4AQ13619 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4AQ13619 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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