Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LSAMPQ13449 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LSAMPQ13449 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.7 ms