Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE3BQ13370 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms