Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms