Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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IFT88Q13099 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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IFT88Q13099 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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IFT88Q13099 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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IFT88Q13099 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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IFT88Q13099 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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