Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms