Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC8Q09428 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms