Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms