Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms