Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms