Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms