Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPB1Q06547 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms