Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms