Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms