Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP27A1Q02318 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms