Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC6A3Q01959 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms