Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDR2Q01850 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDR2Q01850 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms