Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
IFITM3Q01628 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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