Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1BQ00975 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms