Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms