Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms