Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FAM3BP58499 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3BP58499 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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