Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP6P55212 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP6P55212 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms