Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNA2P51530 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNA2P51530 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNA2P51530 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DNA2P51530 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNA2P51530 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNA2P51530 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNA2P51530 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms